Die Ursprünge der EKT gehen auf das Jahr 1905 zurück. Damals wurde die Elektrische Kraftversorgung Bodensee-Thurtal (KBT) mit Sitz in Arbon gegründet. Zweck der KBT war die Versorgung der zirka 40 Gemeinden am südlichen Bodenseeufer und im Thurtal von Bischofszell bis Frauenfeld mit der «elektrischen Kraft». Da sich die Anlagen der KBT schon bald über die drei Kantone Thurgau, St.Gallen und Appenzell Ausserrhoden erstreckten, wurden Verhandlungen zwecks Gründung einer interkantonalen Gesellschaft aufgenommen. 1911 entschied der Kanton Thurgau schliesslich, eigene Wege zu gehen.

Mittels Volksentscheid wurden sämtliche Anlageteile und Energielieferverträge der KBT auf thurgauischem Gebiet erworben. Am 1. Januar 1912 wurde das Elektrizitätswerk des Kantons Thurgau (EKT) als selbständige Anstalt des öffentlichen Rechts gegründet. Der Geschäftssitz wurde in Arbon belassen.

Im Jahr 2001 folgte die Umwandlung in eine selbständige Aktiengesellschaft. 2005 wurde der Unternehmensname auf EKT AG verkürzt und die EKT Holding AG gegründet. Besitzerin der EKT Holding AG ist der Kanton Thurgau.